Laboratorium Inżynierii
Procesów Biotechnologicznych
Laboratorium Inżynierii
Procesów Biotechnologicznych
O laboratorium
Laboratorium łączy kompetencje z zakresu inżynierii chemicznej i procesowej, biotechnologii, mikrobiologii oraz biologii molekularnej. Prowadzi, projektuje i optymalizuje bioprocesy, bada mikroorganizmy i ocenia aktywność biologiczną substancji, ze szczególnym uwzględnieniem bakteriofagów.
Dysponuje cytometrią przepływową (w tym spektralną), reakcją PCR w czasie rzeczywistym, pomiarami mikropłytkowymi, hodowlą w bioreaktorze, mikroskopią kontrastowo-fazową i epifluorescencyjną oraz elektroforezą kwasów nukleinowych. Oferta jest skierowana do jednostek naukowych oraz firm z branży chemicznej, biotechnologicznej, farmaceutycznej, spożywczej i ochrony środowiska.
Cytometr przepływowy Cytek Aurora
Wieloparametrowa analiza komórek metodą cytometrii przepływowej
Nazwa urządzenia:
Cytometr przepływowy CYTEK Aurora 3 Laser V/B/R (Cytek Biosciences, Stany Zjednoczone)
Parametry urządzenia:
- system 3-laserowy, wyposażony w lasery o długościach fal:
- fioletowy (V): 405 nm (100 mW),
- niebieski (B): 488 nm (50 mW),
- czerwony (R): 640 nm (80 mW).
- spektralna cytometria przepływowa (Full Spectrum Profiling – FSP™), umożliwiająca rejestrację pełnego widma emisyjnego każdego fluorochromu, co pozwala na rozróżnianie barwników o zbliżonych maksimach emisji (np. GFP i FITC),
- zestaw wysokoczułych detektorów APD (Avalanche Photodiodes), zapewniających wysoką rozdzielczość sygnału nawet dla słabo wyznakowanych populacji.
Cytometr dostępny w MATPRO jest urządzeniem spektralnym, które znacząco podnosi możliwości badawcze. Aparatura umożliwia analizowanie wielokolorowych paneli. Dodatkowo, posiadamy doświadczenie w analizie cytometrycznej próbek mikrobiologicznych.
Opis usługi:
Laboratorium oferuje zaawansowaną analizę właściwości fizycznych i biologicznych komórek (żywych lub utrwalonych) z wykorzystaniem cytometru przepływowego. Technika ta umożliwia ilościową i jakościową ocenę cech morfometrycznych, fenotypowych i funkcjonalnych komórek, w tym badanie metabolizmu tlenowego, reakcji wolnorodnikowych, aktywacji i proliferacji komórek oraz polimeryzacji białek. Cytometr znajduje zastosowanie w badaniach nad nano- i biomateriałami, biotechnologii zwierząt, mikrobiologii oraz ocenie wpływu nanotechnologii na pojedyncze komórki in vitro. Aparatura jest komplementarna z dostępnym w MATPRO mikroskopem konfokalnym oraz istniejącym zapleczem do badań komórkowych i mikrobiologicznych.
Zakres usługi:
- analiza żywych lub utrwalonych komórek,
- ocena cech morfometrycznych (np. wielkość, ziarnistość),
- analiza struktur wewnątrzkomórkowych,
- fenotypowanie komórek (np. rodzaj białek błonowych i cytoplazmatycznych),
- badanie metabolizmu tlenowego i reakcji wolnorodnikowych ,
- ocena aktywności enzymatycznej,
- monitorowanie procesów: apoptozy (różne stadia), nekrozy, mikrowezykulacji ,
- analiza procesów: fagocytozy, pinocytozy, sekrecji komórkowej, chemotaksji, adhezji, agregacji,
- monitorowanie stadium komórek mikroorganizmów i linii komórkowych w czasie procesów (np. dezynfekcji wody, powietrza, badania toksyczności).
Cytometr przepływowy to nowoczesna technika analityczna, która umożliwia wieloparametrową, ilościową analizę populacji komórek w czasie rzeczywistym. Dzięki możliwości oceny morfologii, fenotypu, funkcjonalności i stanu komórek, cytometria przepływowa staje się nieocenionym narzędziem w badaniach biologicznych, środowiskowych i technologicznych. W połączeniu z mikroskopią konfokalną oraz istniejącym zapleczem mikrobiologicznym, tworzy unikatowe środowisko badawcze o dużym potencjale aplikacyjnym i komercyjnym.
Cytometr przepływowy BD Accuri C6 Plus
Automatyczna analiza populacji komórkowych metodą cytometrii przepływowej
Nazwa urządzenia:
Cytometr przepływowy BD Accuri C6 Plus z autosamplerem (BD Biosciences, Stany Zjednoczone)
Parametry urządzenia:
- dwa lasery: 488 nm i 640 nm,
- cztery kanały detekcji fluorescencji,
- pomiary rozproszenia światła FSC i SSC,
- autosampler do seryjnego pobierania próbek.
Opis usługi:
Cytometr służy do ilościowej i jakościowej analizy komórek oraz odpowiednio przygotowanych próbek mikrobiologicznych. Automatyczne podawanie próbek ułatwia badania porównawcze i monitorowanie zmian populacji komórkowych w seriach pomiarowych.
Zakres usługi:
- analiza liczebności i charakterystyki populacji komórek,
- ocena żywotności mikroorganizmów z zastosowaniem barwników,
- badania wpływu substancji chemicznych i biologicznych na komórki,
- analiza zmian komórkowych podczas procesów biotechnologicznych,
- pomiary seryjne z wykorzystaniem autosamplera.
Termocykler Bio-Rad CFX96 Real-Time PCR
Badania DNA i ekspresji genów metodą qPCR
Nazwa urządzenia:
Termocykler Bio-Rad CFX96 Real-Time PCR (Bio-Rad Laboratories, Stany Zjednoczone)
Parametry urządzenia:
- format 96-dołkowy,
- monitorowanie amplifikacji DNA przez detekcję fluorescencji w czasie rzeczywistym.
Opis usługi:
System umożliwia wykrywanie oraz względne lub bezwzględne oznaczanie wybranych sekwencji DNA w zakresie wynikającym z zastosowanego testu. Analiza ekspresji genów wymaga wcześniejszej odwrotnej transkrypcji RNA do cDNA (RT-qPCR).
Zakres usługi:
- amplifikacja i detekcja wybranych fragmentów DNA,
- wykrywanie genów organizmów prokariotycznych i eukariotycznych,
- analiza ekspresji wybranych genów metodą RT-qPCR,
- badania porównawcze próbek po ekspozycji na czynniki eksperymentalne,
- analizy molekularne wspomagające charakterystykę mikroorganizmów.
Spektrofotometr mikropłytkowy BioTek Synergy H1
Pomiary absorbancji, fluorescencji i luminescencji
Nazwa urządzenia:
Spektrofotometr mikropłytkowy BioTek Synergy H1 (BioTek / Agilent Technologies, Stany Zjednoczone)
Parametry urządzenia:
- wielofunkcyjny system pomiarowy do analiz mikropłytkowych,
- detekcja absorbancji, fluorescencji i luminescencji.
Opis usługi:
Urządzenie umożliwia wykonywanie analiz chemicznych, biochemicznych i biologicznych w formacie mikropłytkowym. Znajduje zastosowanie m.in. w pomiarach wzrostu mikroorganizmów, testach toksyczności i ocenie aktywności metabolicznej komórek.
Zakres usługi:
- badania toksyczności substancji ciekłych i stałych na referencyjnych szczepach bakterii,
- pomiary gęstości optycznej hodowli bakteryjnych,
- ocena aktywności metabolicznej (respiracji) komórek metodą z resazuryną,
- analizy fluorescencyjne i luminescencyjne z odpowiednimi zestawami odczynnikowymi,
- porównawcze badania formulacji i biomateriałów.
Bioreaktor Sartorius BIOSTAT A
Kontrolowane prowadzenie hodowli i optymalizacja bioprocesów
Nazwa urządzenia:
Bioreaktor Sartorius BIOSTAT A, 2 l (Sartorius, Niemcy)
Parametry urządzenia:
- objętość robocza hodowli do 2 l,
- mieszanie i napowietrzanie (natlenianie) hodowli,
- pomiar pH w trakcie procesu.
Opis usługi:
Bioreaktor umożliwia namnażanie biomasy mikroorganizmów i prowadzenie badań procesowych w kontrolowanych warunkach laboratoryjnych. Służy do ustalania zależności między parametrami prowadzenia hodowli a efektywnością wzrostu mikroorganizmów.
Zakres usługi:
- namnażanie komórek bakteryjnych,
- optymalizacja warunków mieszania i natleniania,
- ocena wpływu parametrów procesu na wzrost biomasy,
- monitorowanie pH hodowli,
- przygotowanie biomasy do dalszych analiz.
Mikroskop kontrastowo-fazowy Delta Optical L1000
Obserwacje komórek i mikroorganizmów oraz dokumentacja preparatów
Nazwa urządzenia:
Mikroskop kontrastowo-fazowy Delta Optical L1000 z modułem epifluorescencji (Delta Optical, Polska)
Parametry urządzenia:
- oświetlenie LED, kontrast fazowy i moduł epifluorescencji,
- kamera cyfrowa 14 MP,
- powiększenie do 1000×,
- rejestracja zdjęć i filmów.
Opis usługi:
Mikroskop pozwala prowadzić przyżyciowe obserwacje komórek i mikroorganizmów, w trybie kontrastu fazowego bez konieczności barwienia preparatów. Obrazowanie fluorescencyjne wymaga odpowiednich znaczników i przygotowania preparatów.
Zakres usługi:
- obserwacje przyżyciowe komórek i mikroorganizmów,
- ocena żywotności komórek,
- analiza zmian morfologicznych,
- obrazowanie kontrastowo-fazowe i epifluorescencyjne,
- fotograficzna i filmowa dokumentacja eksperymentów.
System elektroforezy E-Gel Power Snap Plus
Rozdział elektroforetyczny i obrazowanie kwasów nukleinowych
Nazwa urządzenia:
System wizualizacji żeli agarozowych E-Gel™ Power Snap Plus (Thermo Fisher Scientific, Stany Zjednoczone)
Parametry urządzenia:
- rozdział elektroforetyczny w żelach agarozowych,
- moduł obrazowania i dokumentowania wyników.
Opis usługi:
System umożliwia rozdział i wizualizację fragmentów DNA, a przy odpowiednio dobranych żelach i protokołach także próbek RNA. Służy m.in. do kontroli produktów PCR i dokumentowania wyników badań molekularnych.
Zakres usługi:
- rozdział elektroforetyczny DNA,
- wizualizacja produktów PCR,
- analiza próbek DNA/RNA dostarczonych przez użytkownika,
- dokumentacja obrazowa żeli.
